Çalışma, bisfenol A ile depresyon arasındaki olası moleküler bağlantıları haritalandırıyor
Araştırmacılar, BPA kimyasalının depresyona katkıda bulunabileceği hedefleri ve yolakları incelemek için veri tabanlarından, simülasyonlardan ve fareler üzerindeki deneylerden yararlandı.
Yapay zekâ illüstrasyonuAraştırmacılar, bisfenol A'nın (BPA) depresyonla ilişkili olabileceği moleküler yolları aramak için bilgisayar modellemesini, gen ekspresyonu verilerini ve fare testlerini bir araya getirdi.
Ekip, BPA'yı yaygın bir çevresel endokrin bozucu olarak tanımlıyor. Araştırmacılara göre bu kimyasal kan-beyin bariyerini aşabiliyor ve depresyonun gelişimiyle yakından ilişkili nörotoksik etkiler gösterebiliyor. Ayrıca BPA kaynaklı depresyonun ardındaki kesin moleküler hedeflerin ve sinyal yolaklarının hâlâ yeterince anlaşılmadığını belirtiyorlar.
Çalışma, bu boşluğu gidermek için olası BPA hedeflerini ChEMBL, STITCH ve SwissTargetPrediction veri tabanlarından, depresyonla ilişkili hedefleri ise GeneCards, OMIM ve TTD'den derledi. Her iki kümede ortak olan hedefler bir PPI ağı oluşturmak için kullanıldı ve GO ile KEGG zenginleştirme analizlerinden geçirildi.
Araştırmacılar ardından BPA'nın merkezdeki ana hedeflere ne kadar güçlü ve ne kadar kararlı bağlandığını kontrol etmek için moleküler yerleştirme ve 100 ns'lik moleküler dinamik simülasyonlarını kullandı. Çalışmada ayrıca bir GEO transkriptomik veri setinden ve farelerde yapılan in vivo doğrulama deneylerinden yararlanıldı.
Ekip, toplamda BPA ile depresyon arasında 29 örtüşen hedef bildiriyor.