Исследование описывает возможные молекулярные связи между бисфенолом А и депрессией
Исследователи использовали базы данных, симуляции и эксперименты на мышах, чтобы изучить мишени и пути, через которые химическое вещество BPA может способствовать развитию депрессии.
Иллюстрация, созданная ИИИсследователи объединили компьютерное моделирование, данные об экспрессии генов и опыты на мышах, чтобы найти молекулярные пути, по которым бисфенол А (BPA) может быть связан с депрессией.
Авторы описывают BPA как широко распространённый эндокринный разрушитель окружающей среды. По словам исследователей, это вещество способно преодолевать гематоэнцефалический барьер и оказывать нейротоксическое действие, тесно связанное с развитием депрессии. Они добавляют, что точные молекулярные мишени и сигнальные пути, лежащие в основе вызванной BPA депрессии, остаются малоизученными.
Чтобы восполнить этот пробел, в исследовании были получены возможные мишени BPA из баз данных ChEMBL, STITCH и SwissTargetPrediction, а мишени, связанные с депрессией, — из GeneCards, OMIM и TTD. Общие для обоих наборов мишени использовали для построения PPI-сети и проанализировали методами обогащения GO и KEGG.
Затем исследователи с помощью молекулярного докинга и симуляций молекулярной динамики длительностью 100 ns проверили, насколько прочно и стабильно BPA связывается с ключевыми центральными мишенями. В работе также использовались транскриптомный набор данных GEO и эксперименты по валидации in vivo на мышах.
В общей сложности авторы сообщают о 29 пересекающихся мишенях между BPA и депрессией.